Parken utgjør et areal på 7.500 km2 med hundrevis av elver og innsjøer rik på fiskeliv. De mest kjente innsjøer er: Gutiérrez, Mascardi, Hess, Fonk, Martín og Nahuel Huapi.

Den sistnevnte også den viktigste, ligger i midten av parken og utgjør et areal på 560 km2. Ved Blest området har innsjøen en dybde på 464 meter. De høyeste fjellene i parken markerer grensen mellom Chile og Argentina, hvor Cerro Tronador med sine 3554 m.o.h. er høyest. Andre viktige fjell er Catedral (2388 m.o.h) og Bayo (1750 m.o.h). Begge har blitt bygget ut og utviklet til viktige skisentre i regionen med flotte skiforhold og bra infrastruktur.